安徽省应用型高峰培育学科，具有基础医学一级学科硕士学位授权点。皖南医学院基础医学学科属于医学门类中的一级学科，建于1958年，1977年开始本科教育，1979年开始硕士研究生教育，2010年获批基础医学一级学科硕士点，2022年获批安徽省应用型高峰培育学科。基础医学本科专业秉持“厚基础、强能力、重创新”的人才培养理念，实施本科生导师制和早团队、早实验、早选题的“三早”科研育人模式，以高水平的师资团队，对学生思想品德、学业学术、创新创业、职业规划等提供全面指导，保障本科生顺转继续攻读研究生，努力培养具有创新思维、崇尚科学、能担大任的医学拔尖人才。
学制、学位与学费：学制五年，授予医学学士学位；5200元/生·学年。
就业面向：主要就业去向包括继续从事医学领域硕博研究生深造学习，或在医学院校、医疗机构和科研院所专门从事医学教育和科学研究工作，以及在生物医药与生命健康领域从事产学研用工作等。
